2002年9月10日，经国务院批复同意，国家海洋局在北京发布《全国海洋功能区划》。国务院在批复中强调指出，海洋功能区划是我国海域使用管理和海洋环境保护的依据，具有法定效力，必须严格执行。国家海洋局新闻发言人王飞说，今后，凡是用海的项目都要首先报批审查，符合功能区划的才能取得海域使用证，这就相当于陆地上的土地使用证。海洋功能区划是根据海域区位、自然资源、环境条件和开发利用的要求，将海域划分为不同类型的功能区，从而可以控制、引导海域的使用方向，保护、改善海洋生态环境。《全国海洋功能区划》将我国管辖海域划定了港口航运区、渔业资源利用与养护区、旅游区、海水资源利用区、工程用海区、海洋保护区、特殊利用区、保留区等10种主要海洋功能区，确定了渤海、黄海、东海、南海四大海区中30个重点海域的主要功能，并提出了每种海洋功能区的开发保护重点和管理要求。截至2000年，我国海域使用面积200多万公顷，其中，海水养殖120多万公顷，盐田40多万公顷，港口20多万公顷，油气开采20多万公顷，海洋倾废区0.2万公顷，铺设海底电缆管道13500多公里。另外，我国已经建立海洋自然保护区69个，总面积130多万公顷。