1965年6月22日，日本和南朝鲜在东京签订该条约，建立外交关系。

1948年朝鲜分裂为两个国家，美国要求日本与南朝鲜(大韩民国)单独建交。1951年10月，日韩建交预备会议开始。自1952年2月至1964年4月，日韩举行6次正式会谈，但因清算日本殖民统治、财产请求权、战争赔偿、捕渔范围、旅日朝鲜人地位、竹岛归属等纠纷，谈判一再陷入僵局。

1964年美国出于侵越战争的需要，极力撮合形成以《日美安全保障条约》为轴心的“日韩命运共同体”。在这种情况下，日韩在同年12月开始的第7次会谈中相互妥协，1965年2月双方草签《日韩基本条约》。同年6月22日在日本首都东京正式签约。

条约规定：1910年日韩合并以前缔结的条约一律无效；根据联合国《第195号决议》承认韩国政府为朝鲜唯一合法政府，施政范围在北纬38度线以南；互设大使馆和领事馆等。